Dinginkan nasi dan bahan matang apa pun hingga suhu ruangan sebelum mengemasnya ke dalam kotak, karena menutup makanan hangat dalam wadah tertutup memerangkap uap yang berubah menjadi kondensasi dan membuat semuanya basah kuyup saat waktu makan siang tiba. Kemas makanan rapat ke dinding kotak dan satu sama lain dengan sedikit ruang kosong, karena makanan yang dikemas longgar bergeser saat transportasi dan mengubah penataan rapi menjadi berantakan. Pisahkan bahan basah seperti saus atau sayuran berbumbu dari yang kering menggunakan pembatas kecil atau cup silikon, karena cairan yang menyentuh nasi atau kerupuk selama beberapa jam membuatnya lembek dan tidak menggugah selera. Gunakan hanya bahan yang sudah matang sepenuhnya dan tiris dengan baik jika bento akan berada tanpa pendingin lebih dari satu atau dua jam, karena makanan mentah atau kurang matang yang dibiarkan pada suhu ruangan dalam waktu lama adalah salah satu penyebab paling umum keracunan makanan. Tambahkan bahan antibakteri seperti sebutir kecil ume boshi di atas nasi atau sedikit cuka di dalam nasi itu sendiri, karena tambahan tradisional ini benar-benar memperlambat pertumbuhan bakteri dalam makan siang yang tidak akan didinginkan sampai dimakan. Seimbangkan warna dan kelompok makanan di seluruh kotak, dengan tujuan dasar nasi atau biji-bijian, protein, dan setidaknya dua sayuran, karena bento dengan hanya satu atau dua warna biasanya menandakan makanan yang tidak seimbang secara nutrisi bahkan sebelum kamu memeriksa bahannya.