Laissez le riz et tout ingrédient cuit refroidir à température ambiante avant de les emballer dans la boîte, car sceller des aliments chauds dans un récipient fermé emprisonne la vapeur qui se transforme en condensation et rend tout détrempé au moment du déjeuner. Emballez les aliments serrés contre les parois de la boîte et les uns contre les autres avec peu d'espace vide, car des aliments emballés de manière lâche se déplacent pendant le transport et transforment un arrangement soigné en fouillis. Séparez les ingrédients humides comme les sauces ou les légumes assaisonnés des ingrédients secs à l'aide de petits diviseurs ou de coupelles en silicone, car le liquide qui touche le riz ou les crackers pendant plusieurs heures les rend mous et peu appétissants. Utilisez uniquement des ingrédients entièrement cuits et bien égouttés si le bento restera non réfrigéré pendant plus d'une heure ou deux, car les aliments crus ou pas assez cuits laissés à température ambiante pendant une période prolongée sont l'une des causes les plus courantes d'intoxication alimentaire. Ajoutez des ingrédients antibactériens comme une petite prune umeboshi sur le riz ou un peu de vinaigre dans le riz lui-même, car ces ajouts traditionnels ralentissent véritablement la croissance bactérienne dans un déjeuner qui ne sera pas réfrigéré avant d'être mangé. Équilibrez couleur et groupes d'aliments dans toute la boîte, en visant une base de riz ou de céréales, une protéine, et au moins deux légumes, car un bento avec seulement une ou deux couleurs signale généralement un repas nutritionnellement déséquilibré avant même de vérifier les ingrédients.