Kontrolujte vlhkosť pôdy denne tak, že zatlačíte prst do vrchnej vrstvy, namiesto zalievania podľa pevného rozvrhu, pretože plytký hrniec bonsaja vysychá oveľa rýchlejšie než bežná izbová rastlina, a tak podlievanie, ako aj prelievanie môže strom zabiť do niekoľkých dní. Zalievajte dôkladne, kým voda nezačne odtekať z otvorov na dne hrnca, namiesto ľahkého postriekania, pretože povrchové zalievanie zvlhčuje iba vrchnú vrstvu pôdy a necháva hlbšie korene suché, aj keď povrch vyzerá vlhko. Prerezávajte a drôtujte konáre iba vo vhodnom ročnom období stromu, pretože rezanie alebo ohýbanie v nesprávnom čase roka môže šokovať aktívne rastúci strom alebo poškodiť kôru, ktorá je počas vegetačného pokoja krehká. Odstráňte drôt skôr, než sa zareže do kôry pri hrubnutí konára, pretože drôt ponechaný príliš dlho zanecháva trvalé jazvy, ktorých zarastanie môže trvať roky. Presádzajte podľa cyklu vhodného pre daný druh, väčšinou každé jeden až päť rokov podľa stromu, namiesto toho aby ste ho nechávali v tej istej pôde donekonečna, pretože stará, zhutnená pôda nakoniec prestane správne odvádzať vodu a pomaly dusí korene. Majte na pamäti špecifické nároky druhu na svetlo a teplotu, namiesto toho aby ste so všetkými bonsajmi zaobchádzali rovnako, pretože niektoré druhy potrebujú zažiť vonkajšiu zimu, aby prežili dlhodobo, zatiaľ čo iné musia zostať vnútri po celý rok.