Sprawdzaj wilgotność gleby codziennie, wciskając palec w wierzchnią warstwę, zamiast podlewać według stałego harmonogramu, ponieważ płytka doniczka bonsai wysycha znacznie szybciej niż zwykła roślina doniczkowa, a zarówno niedostateczne, jak i nadmierne podlewanie może zabić drzewko w ciągu kilku dni. Podlewaj obficie, aż woda zacznie odpływać przez otwory w dnie doniczki, zamiast lekko spryskiwać, ponieważ płytkie podlewanie zwilża tylko wierzchnią warstwę gleby, pozostawiając głębsze korzenie suche, mimo że powierzchnia wygląda na wilgotną. Przycinaj i drutuj gałęzie tylko w odpowiedniej dla drzewka porze roku, ponieważ cięcie czy zginanie w niewłaściwym okresie może zaszokować aktywnie rosnące drzewko lub uszkodzić korę, która jest krucha w okresie spoczynku. Usuwaj drut, zanim wetnie się w korę w miarę pogrubiania gałęzi, ponieważ drut pozostawiony zbyt długo pozostawia trwałe blizny, których zarośnięcie może zająć lata. Przesadzaj według cyklu odpowiedniego dla danego gatunku, zwykle co jeden do pięciu lat w zależności od drzewka, zamiast zostawiać je w tej samej ziemi bezterminowo, ponieważ stara, zbita ziemia w końcu przestaje prawidłowo odprowadzać wodę i powoli dusi korzenie. Miej na uwadze specyficzne potrzeby świetlne i temperaturowe danego gatunku zamiast traktować wszystkie bonsai tak samo, ponieważ niektóre gatunki muszą przeżyć zimę na dworze, by przetrwać długoterminowo, podczas gdy inne muszą pozostać w pomieszczeniach przez cały rok.